Az emberi erőforrások minisztere a 2013-16 közötti minősítési időszakra kutatóegyetemmé minősítette a a Pécsi Tudományegyetemet, a Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetemet, a Debreceni Egyetemet, az Eötvös Loránd Tudományegyetemet, a Semmelweis Egyetemet és a Szegedi Tudományegyetemet.
A kutatóegyetemi cím odaítélésekor alapvető feltétel, hogy olyan minőségi kritériumoknak feleljenek meg a pályázók, mint a folyamatos, nagyarányú kutatás, hazai és nemzetközi fejlesztések és innovációk, kiemelt tehetséggondozás, valamint széles körű nemzetközi együttműködések.